Des espèces uniques, dites endémiques car retrouvées exclusivement dans les îles d’Or, vont pouvoir y trouver abri et nourriture en quantité suffisante (phyllodactyle, discoglosse sarde). Des espèces introduites naturellement ou accidentellement sont également présentes. La prolifération de certaines espèces terrestres, due notamment à l’absence de prédateurs naturels, est également problématique (exemple : le rat noir).
La faune marine (tant mobile que fixée) y est très riche, notamment grâce à la variété des fonds marins (herbiers de posidonie, coralligène, petits fonds rocheux, fonds sableux…) et grâce aux efforts de protection et de gestion de la partie marine du Parc national.
Diversité de la faune en quelques chiffres
Espèces terrestres
- Mammifères : 12 espèces dont 7 de chauve-souris
- Oiseaux : 177 espèces dont 26 nicheuses
- Reptiles : 6 espèces
- Amphibiens : 2 espèces
- Invertébrés (coléoptères) : 248 espèces
- Orthoptères : 34 espèces
- Hyménoptères : 25 espèces
- Lépidoptères : 248 espèces
- Odonates : 17 espèces
- Arachnides : 232 espèces
- Mollusques : 17 espèces
Espèces marines
- Poissons : 180 espèces
- Crustacés : 265 espèces
- Spongiaires : 92 espèces
- Echinodermes : 53 espèces
- Mollusques : 173 espèces
- Reptiles marins : 3 espèces
- Cétacés : 8 espèces
Ces chiffres ne sont donnés qu’à titre indicatif, de nombreux inventaires sont en cours de réactualisation.