Cette démarche pédagogique s'appuie sur des partenariats construits avec la direction académique des services de l'Education nationale du Var (Académie de Nice) ainsi qu'Agricampus Var (ministère de l'Agriculture). Elle privilégie les écoles et les établissements scolaires des communes de l'aire d'adhésion. Ces actions s'inscrivent dans le cadre d'une généralisation de l'éducation à l'environnement pour un développement durable et aux enjeux qui s'y rattachent. Ils favorisent la connaissance du patrimoine naturel et culturel de proximité et permettent le développement d'une citoyenneté active et responsable vis-à-vis des milieux et des territoires.

Le Parc national de Port-Cros favorise une démarche partenariale pour concevoir et accompagner des projets pédagogiques pluridisciplinaires intégrant des approches scientifiques, socio-économiques, historiques, et culturelles. Par son expertise dans le domaine de la protection du vivant, de la gestion des espaces naturels et du développement durable, il met en œuvre des actions variées qui peuvent prendre la forme de :

• interventions en classes,
• sorties sur le territoire,
• parcours de sentiers aménagés,
• rencontres et échanges avec les acteurs du territoire,
• visites des espaces muséographiques et de sites historiques,
• d'actions locales de bénévolat
• mises à disposition d'outils pédagogiques et d'expositions thématiques
• actions de découverte des professionnels.

Pour les établissements du second degré, des activités de découverte du milieu marin par l'initiation à la randonnée aquatique encadrées par des structures affiliées à la Fédération Française d'Etudes et de Sports Sous-Marins (FFESSM) sont proposées.

Les projets pédagogiques sont suivis sur toute l'année scolaire avec les classes partenaires et se composent de plusieurs étapes : visites des îles et séjours en immersion, phase de réflexion et de compréhension des enjeux locaux, restitutions et productions de solutions globales.