Depuis 2000, le Parc national de Port-Cros mène avec les pêcheurs professionnels un travail collaboratif de gestion de l’activité dans les eaux du cœur marin de Port-Cros. Une expérience pilote en Méditerranée partie de la mise en place en 1999 de la « Charte de la pêche professionnelle ». 
Elle a permis de définir un cadre de collaboration entre les pêcheurs professionnels, le Parc national et les scientifiques. 
Ce cadre instituait, entre autres, une zone de pêche réservée aux pêcheurs pros, en contrepartie de quoi, ces derniers se sont engagés à remplir des carnets de capture à chaque fois qu’ils venaient pêcher à Port-Cros. 
Deux autres outils sont venus compléter le dispositif : le comptage des signaux de pêche réalisé par les agents du Parc national et l’embarquement de scientifiques et d’agents du Parc national à bord des navires de pêche, pour observer directement les captures et bien connaitre les pratiques : engins, périodes de pêche, etc. 
 

L'exemple emblématique de deux espèces sentinelles
Le Mérou brun et le Corb représentent de véritables ”Grands Témoins” de l'efficacité des mesures de protection mises en place à Port-Cros depuis 50 ans. 
Leur présence et leur comportement nous racontent l'histoire de la restauration écologique marine. Ces deux espèces sont particulièrement vulnérables à la pêche ciblée, notamment la chasse sous-marine, en raison de leur croissance lente, leur maturité sexuelle tardive et leur comportement peu fugitif.

Des résultats spectaculaires mais progressifs  
Les recensements visuels menés depuis les années 1970 montrent une augmentation spectaculaire des populations : en 54 ans (1970-2024), les effectifs de Mérous ont été multipliés par + de 100 autour de Port-Cros, et en 34 ans (1990-2024), la population de Corbs a été multipliée par plus de 18.

Un contexte favorable
Le succès de la protection à Port-Cros résulte d'une combinaison de facteurs : la protection stricte contre les prélèvements ciblés dans le Parc, le moratoire sur la pêche du mérou en vigueur depuis 1993 à l'extérieur du Parc, et un contexte climatique favorable pour ces espèces méridionales.
Le réchauffement climatique a en effet favorisé la reproduction locale du mérou, auparavant impossible dans le nord du bassin méditerranéen occidental, contribuant ainsi à la dynamique positive des populations.

Le modèle de la Gabinière
L'îlot de la Gabinière à Port-Cros constitue un modèle de restauration écologique : en 38 ans, la population de Mérous y a été multipliée par 19, passant de 14 individus estimés en 1973… à 268 en 2011. Plus récemment, en 2024, environ 300 individus ont été comptabilisés autour de la Gabinière qui concentre encore une grande partie des individus. Depuis 2005, les effectifs se sont stabilisés, suggérant que ce site a atteint sa capacité d'accueil maximale en mérous, déterminée par les ressources disponibles en nourriture et en habitats.

Trois enseignements majeurs s’imposent après plusieurs décennies d'expérience

• L'approche écosystémique intégrative (approche qui intègre l‘ensemble de l’écosystème) est plus efficace et moins coûteuse que l'approche espèce par espèce 
• Le mode de gestion MUM (Multi-Use Management), où la pêche artisanale est autorisée sous conditions strictes, a démontré son efficacité quand elle s'appuie sur la sectorisation des usages et le suivi continu de l'effort de pêche et des captures.
• Les écosystèmes marins méditerranéens sont des socio-écosystèmes où l'homme et la pêche artisanale ont toute leur place et peuvent même contribuer à un état plus "naturel" du milieu.

Une référence pour la Méditerranée
Les populations de Mérous et de Corbs à Port-Cros montrent qu'en l'absence de pêche ciblée, les habitats méditerranéens côtiers peuvent soutenir des populations abondantes, sans commune mesure avec ce que l'on observe généralement en dehors des Aires Marines Protégées. Cette situation a conduit l'UICN (Union Internationale pour la Conservation de la Nature) à classer ces espèces comme “en danger” pour le Mérou, et “vulnérable” pour le Corb, soulignant l'importance des zones protégées pour leur conservation.

La nécessité d'une protection à long terme
La lenteur du processus de restauration justifie le maintien à long terme des mesures de protection telles que le moratoire sur la pêche du Mérou et son extension souhaitable au Corb. L'expérience de Port-Cros montre qu'une protection efficace nécessite de la patience : les effets les plus spectaculaires se manifestent après plusieurs décennies.

Des outils face aux menaces émergentes
Les suivis à long terme du Mérou et du Corb constituent des références inestimables pour évaluer la qualité des mesures de gestion et, plus largement, le statut des communautés littorales. Ces suivis permettent également de maintenir une veille face à des menaces émergentes, comme les épidémies à nodavirus qui ont provoqué des mortalités dans certaines populations méridionales de mérous.

Une vision « référence » à l’échelle globale
L'effet réserve ne se limite pas à ces deux espèces emblématiques. La protection bénéficie à l'ensemble de l'écosystème, avec des chaînes trophiques (alimentaires) plus équilibrées et une biodiversité accrue. L'augmentation des effectifs s'est accompagnée d'une expansion territoriale.